FC橫濱（Yokohama FC），于1999年成立，當時橫濱市兩大球會橫濱飛翼和橫濱水手合併後的第二年，因為橫濱水手是橫濱飛翼是同城死敵，一些橫濱飛翼的球迷不認為自己應該支持合併後的橫濱水手，所以，他們向公眾募捐，成立了橫濱Fulie體育會（Yokohama Fulie Sports Club）。然後效仿巴賽隆納採用的社會學模式，在Fulie體育會下成立了橫濱FC。這是日本首間由球迷擁有和經營的球會。

　　1999年，FC橫濱聘請了前西德國家足球隊球星列巴斯基成為經理，奧寺康彥則為成首任主席，奧寺康彥是首位於歐洲職業聯賽效力的日本球員。

　　2001賽季，FC橫濱獲得了參加J2聯賽的資格；2006年，FC橫濱取得J2冠軍，升上J1聯賽；但僅一個賽季，就重回J2聯賽。2019年，FC橫濱獲得昇級資格，將在14年後再次踏上J1的舞臺。