日聯盃小組賽：由J1、J2及J3聯賽所屬球隊參加。參加亞冠聯賽的3支球隊則被視作“種子隊”，豁免參與小組賽。其餘57支球隊分成10個小組，進行單循環小組賽，每組首名出線。

淘汰賽：從小組賽出線的10支球隊進行主客淘汰賽，勝出者進入八強賽。參加亞冠聯賽的3支球隊從八強賽加入賽事。